MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii D1279779 plasmid pD1279779

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020525	ATTA	2	8	177	184	50 %	50 %	0 %	0 %	469820174
2	NC_020525	TTC	2	6	224	229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	469820174
3	NC_020525	ATCA	2	8	307	314	50 %	25 %	0 %	25 %	469820174
4	NC_020525	TGA	2	6	363	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
5	NC_020525	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820174
6	NC_020525	GTGA	2	8	442	449	25 %	25 %	50 %	0 %	469820174
7	NC_020525	GTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820174
8	NC_020525	AGA	2	6	525	530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820174
9	NC_020525	ACA	2	6	552	557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820174
10	NC_020525	ATTG	2	8	603	610	25 %	50 %	25 %	0 %	469820174
11	NC_020525	GTA	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820174
12	NC_020525	A	6	6	662	667	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
13	NC_020525	A	6	6	709	714	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
14	NC_020525	A	8	8	827	834	100 %	0 %	0 %	0 %	469820174
15	NC_020525	ATG	2	6	1069	1074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020525	A	6	6	1139	1144	100 %	0 %	0 %	0 %	469820175
17	NC_020525	AT	3	6	1193	1198	50 %	50 %	0 %	0 %	469820175
18	NC_020525	AAAG	2	8	1285	1292	75 %	0 %	25 %	0 %	469820175
19	NC_020525	TCAA	2	8	1302	1309	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
20	NC_020525	TCAA	2	8	1312	1319	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
21	NC_020525	ATCA	2	8	1410	1417	50 %	25 %	0 %	25 %	469820175
22	NC_020525	AGATC	2	10	1441	1450	40 %	20 %	20 %	20 %	469820175
23	NC_020525	TGA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820175
24	NC_020525	ACT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820175
25	NC_020525	T	7	7	1660	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	469820175
26	NC_020525	TAAA	2	8	1689	1696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020525	AATA	2	8	1714	1721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020525	A	8	8	1744	1751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020525	TAT	2	6	1835	1840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020525	TAA	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020525	TAA	2	6	1875	1880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020525	GTAAA	2	10	1908	1917	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020525	ATT	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020525	AAT	2	6	1934	1939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020525	AT	4	8	1980	1987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020525	TAA	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020525	ATC	2	6	2032	2037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	469820176
38	NC_020525	T	6	6	2039	2044	0 %	100 %	0 %	0 %	469820176
39	NC_020525	A	7	7	2045	2051	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
40	NC_020525	TGC	2	6	2066	2071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820176
41	NC_020525	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
42	NC_020525	CTCG	2	8	2089	2096	0 %	25 %	25 %	50 %	469820176
43	NC_020525	AT	3	6	2108	2113	50 %	50 %	0 %	0 %	469820176
44	NC_020525	ATTG	2	8	2147	2154	25 %	50 %	25 %	0 %	469820176
45	NC_020525	CAGT	2	8	2159	2166	25 %	25 %	25 %	25 %	469820176
46	NC_020525	ACTT	2	8	2186	2193	25 %	50 %	0 %	25 %	469820176
47	NC_020525	AG	3	6	2211	2216	50 %	0 %	50 %	0 %	469820176
48	NC_020525	CAA	2	6	2217	2222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820176
49	NC_020525	A	6	6	2226	2231	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
50	NC_020525	A	7	7	2255	2261	100 %	0 %	0 %	0 %	469820176
51	NC_020525	AACTT	2	10	2263	2272	40 %	40 %	0 %	20 %	469820176
52	NC_020525	T	6	6	2271	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	469820176
53	NC_020525	CAAA	2	8	2293	2300	75 %	0 %	0 %	25 %	469820176
54	NC_020525	TCT	2	6	2358	2363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020525	TAAA	2	8	2373	2380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020525	ACC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_020525	T	8	8	2448	2455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020525	CTT	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020525	AAT	2	6	2493	2498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020525	T	6	6	2534	2539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020525	ATT	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020525	T	6	6	2593	2598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020525	TATC	2	8	2636	2643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020525	GATC	2	8	2662	2669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020525	ACA	2	6	2699	2704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020525	ATA	2	6	2705	2710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020525	TCAG	2	8	2712	2719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020525	CCTA	2	8	2745	2752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_020525	T	6	6	2791	2796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020525	AT	3	6	2830	2835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020525	AATG	2	8	2894	2901	50 %	25 %	25 %	0 %	469820177
72	NC_020525	GTT	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820177
73	NC_020525	ACA	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	469820177
74	NC_020525	GTC	2	6	2982	2987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	469820177
75	NC_020525	TAG	2	6	2991	2996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820177
76	NC_020525	T	6	6	3071	3076	0 %	100 %	0 %	0 %	469820177
77	NC_020525	TAA	2	6	3127	3132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820177
78	NC_020525	TC	3	6	3187	3192	0 %	50 %	0 %	50 %	469820177
79	NC_020525	ATT	2	6	3233	3238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820178
80	NC_020525	AG	3	6	3254	3259	50 %	0 %	50 %	0 %	469820178
81	NC_020525	A	6	6	3274	3279	100 %	0 %	0 %	0 %	469820178
82	NC_020525	TGA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820178
83	NC_020525	AGAA	2	8	3343	3350	75 %	0 %	25 %	0 %	469820178
84	NC_020525	TAA	3	9	3513	3521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820178
85	NC_020525	TGC	2	6	3582	3587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020525	AGA	2	6	3597	3602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020525	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020525	ATG	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020525	TTTAA	2	10	3824	3833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020525	T	6	6	3914	3919	0 %	100 %	0 %	0 %	469820179
91	NC_020525	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820179
92	NC_020525	AGC	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820179
93	NC_020525	GAT	2	6	4120	4125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820179
94	NC_020525	TA	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	469820179
95	NC_020525	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820179
96	NC_020525	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820179
97	NC_020525	AATT	2	8	4405	4412	50 %	50 %	0 %	0 %	469820179
98	NC_020525	T	6	6	4430	4435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020525	TAA	2	6	4443	4448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020525	A	6	6	4474	4479	100 %	0 %	0 %	0 %	469820180
101	NC_020525	AATG	2	8	4485	4492	50 %	25 %	25 %	0 %	469820180
102	NC_020525	AG	3	6	4519	4524	50 %	0 %	50 %	0 %	469820180
103	NC_020525	CCTTT	2	10	4537	4546	0 %	60 %	0 %	40 %	469820180
104	NC_020525	TAA	2	6	4742	4747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820180
105	NC_020525	ATT	2	6	4770	4775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820180
106	NC_020525	TGA	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	469820180
107	NC_020525	TGT	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
108	NC_020525	TTG	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	469820180
109	NC_020525	ATTT	2	8	5008	5015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020525	T	6	6	5038	5043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020525	GTA	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020525	ATT	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020525	A	7	7	5136	5142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020525	TAG	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020525	T	6	6	5262	5267	0 %	100 %	0 %	0 %	469820181
116	NC_020525	CATT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	0 %	25 %	469820181
117	NC_020525	AGA	2	6	5358	5363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
118	NC_020525	AT	3	6	5393	5398	50 %	50 %	0 %	0 %	469820181
119	NC_020525	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
120	NC_020525	ATT	2	6	5454	5459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	469820181
121	NC_020525	GCA	2	6	5477	5482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	469820181
122	NC_020525	AG	3	6	5496	5501	50 %	0 %	50 %	0 %	469820181
123	NC_020525	AGA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
124	NC_020525	A	7	7	5625	5631	100 %	0 %	0 %	0 %	469820181
125	NC_020525	AGA	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	469820181
126	NC_020525	A	6	6	5714	5719	100 %	0 %	0 %	0 %	469820181
127	NC_020525	ATA	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
128	NC_020525	GGT	2	6	5775	5780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	469820181
129	NC_020525	TGTC	2	8	5855	5862	0 %	50 %	25 %	25 %	469820181
130	NC_020525	TAA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	469820181
131	NC_020525	GTGGC	2	10	5918	5927	0 %	20 %	60 %	20 %	469820181
132	NC_020525	ATA	2	6	5975	5980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020525	TTG	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020525	GAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020525	AAG	2	6	6193	6198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020525	ATTT	2	8	6217	6224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020525	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020525	ATT	2	6	6274	6279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020525	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020525	T	6	6	6303	6308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020525	TTCA	2	8	6315	6322	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020525	TATT	2	8	6339	6346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020525	ACA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_020525	AAT	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020525	A	6	6	6400	6405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020525	TCA	2	6	6452	6457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020525	T	7	7	6459	6465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020525	AT	3	6	6498	6503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020525	GTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020525	A	6	6	6557	6562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020525	T	8	8	6568	6575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020525	T	6	6	6597	6602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020525	AAC	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020525	T	7	7	6638	6644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020525	A	7	7	6664	6670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020525	ATC	2	6	6707	6712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_020525	GTG	2	6	6722	6727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020525	TG	3	6	6726	6731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020525	A	7	7	6734	6740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020525	A	6	6	6814	6819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020525	TATT	2	8	6821	6828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020525	TTCA	2	8	6865	6872	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_020525	A	6	6	6957	6962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020525	A	6	6	6997	7002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020525	AG	3	6	7009	7014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020525	CT	3	6	7095	7100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_020525	T	7	7	7109	7115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020525	A	7	7	7182	7188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020525	AGCGA	2	10	7196	7205	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_020525	TTGCTT	2	12	7214	7225	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_020525	A	6	6	7253	7258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020525	CGA	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_020525	AGCGAA	2	12	7275	7286	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
174	NC_020525	AGCGA	2	10	7302	7311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_020525	TTTA	2	8	7391	7398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.